Ciao,
dipende che software usa chi ti passa il modello e che modello č, comunque il modo migliore trovo sia avere un singolo file oggetto (quindi formato OBJ o DXF non cambia) per materiale o layer soprattutto se si esporta da sketchup o rhino.
In questo modo anche e sopratutto in caso di modifiche al modello possono inviarti solo la parte interessata, e non devi ripulire tutto, ti assicuro che ti fa guadagnare un casino di tempo.

Tieni conto che da rhino in lwo ti esporta un materiale per superfice (quindi migliaia di materiali), e in obj un singolo materiale.Ci sono script che salvano i singoli layer in file separati. Spero sia d'aiuto!